1. Находите файл, который хотите подписать.
2. На него правой кнопкой мыши, КриптоАРМ->Подписать.
3. Появится одноименный файл, на рабочем столе или там же.
Это и есть подписанный файл.

4. Закрываете окно подписи. Не обращаете внимания на предупреждение.
5. Если появляется какой-либо запрос, то читаете и поступаете по логике.

Если что звоните, до свидания.